В России создана Национальная база данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2. Разработчиком этой программы и консолидирующим центром стал Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, сообщается [1] на сайте ведомства.
До сих пор информация о мутациях (геномных последовательностях) вируса SARS-CoV-2 из России была разрозненной, что в условиях продолжающейся пандемии является тормозящим фактором в борьбе новой коронавирусной инфекцией.
В соответствии с распоряжением Правительства РФ о необходимости создания единого информационного центра для анализа эпидемической ситуации и отслеживания циркулирующих в стране геновариантов коронавируса в ЦНИИ Эпидемиологии была разработана и введена в действие платформа «VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia). Сервис RuStrain». Платформа включает в себя базу данных «VGARus» (Свидетельство о государственной регистрации №2021621178 от 02.06.2021)и программное обеспечение, позволяющее осуществлять агрегацию информации о геномах вирусов, сортировать, характеризовать и анализировать поступающие данные.
База данных «VGARus» содержит информацию о нуклеотидных последовательностях вирусов SARS-CoV-2 и их мутациях, распространенных в тех или иных регионах РФ, и может быть использована для хранения, систематизации и выборки данных для выявления мутаций и определения штаммов вирусов.
Программное обеспечение, интегрированное в платформу «VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia). Сервис RuStrain» позволяет анализировать результаты секвенирования, определять вероятный штамм вируса, формировать стандартизированные отчёты, загружать образцы, предназначенные для дальнейшего секвенирования.
Превью — pixabay.com
Ссылки
[1] https://www.rospotrebnadzor.ru/about/info/news/news_details.php?ELEMENT_ID=18101
[2] https://zviazda.by/ru/tags/sars-cov-2
[3] https://zviazda.by/ru/tags/rospotrebnadzor
[4] https://zviazda.by/ru/tags/medicina
[5] https://zviazda.by/ru/tags/baza-dannyh